1.Keď si zapnete hru, tak sa zjavíte v laboratóriu v ktorom ste boli v AC1.Ukáže sa vám ukážka ako sa Ezio narodil. Potom vás vezme Giovanni a budete stláčat tlačítka ako vám ukážu na dolnej strane obrazovky. A už ste na svete. Susan vás zavolá a vy musíte ísť za ňou. Cestou budú rôzne prekážky. Najvačší pozor si dajte v garáži. Bude tam veľa vojakov. Keď sa dostanete do novej sály, musíte sa porozprávať zo všetkými a potom si ľahnete na červené kreslo. Bude sa vám načítavať hra a potom budete hrať za Ezia. Ako prvé budete musiet zbyť pouličnú bandu ktorá vám bude robiť problémi. Keď ich zbijete príde za vami Eziov brat Federico Auditore. Zavolá vás a vy pôjdete podla zelených značiek na mape. Dostanete sa na vežu a poobzeráte sa po okolí. Zbadáte otvorené okno a zoskočíte z veže do kopy kvetov. Pribehnete k oknu a potom bude ukážka. Keď ukážka skončí vyleziete do okna. Bude ďaľšia ukážka. Budete znova stláčať tlačítka ktoré vám ukážu na dolnej strane obrazovky. Ráno (po skončení ukážy) vás vyženie otec toho dievčata. Budete musieť ujsť z domu lebo na vás pošle stráže. 5. Poslíček (Paperboy) Zájdite k vášmu rodinnému domu, kde už na vás čaká otec. Pošle vás odniesť dokumenty pre Lorenza Medicejského. List si môžete v menu prečítať. Vyrazte k vášmu cieľu, prostá doručovateľská úloha. V uličkách okolo vášho cieľa je pár skupín vašich nepriateľov, tak sa môžete prebojovať cez nich, alebo ich obísť po strechách. V cieli odovzdajte chlapovi list a vráťte sa domov. Zaklopte na dvere a poviete otcovi, že Lorenzo odišiel z mesta. Otec vám povie, že sa po vás pýtali zvyšní členovia rodiny a že máte chvíľu voľna, no bude vás čoskoro opäť potrebovať. Splnenie misie sprístupňuje: úlohu Kuriéra „Donchuan“. 6. Petrucciovo tajomstvo (Petruccio´s Secret) Váš najmladší brat, Petruccio Auditore je chorý a mal by ležať. Aby ste ho dostali naspäť do domu, tak mu chcete splniť jeho želanie, praje si tri vtáčie pierka. Na zozbieranie troch pierok máte dve a pol minúty. Sú na neďalekých strechách, takže nie je problém ich zozbierať. Keď získate všetky tri, časový limit zmizne a pokojne sa môžete vrátiť naspäť do domu. Zabúchajte na dvere a odovzdajte pierka Petrucciovi. Splnenie misie sprístupňuje: zbieranie Pierok. 7. Rodinný priateľ (Friend of the Family) Pri dome je aj vaša matka, Maria Auditore. Povie vám, že potrebuje niečo zariadiť a chce, aby ste ju sprevádzali. Je to úplne jednoduchá misia, ktorej cieľom je, aby vás matka zoznámila s Leonardom Da Vincim. Len ju nasledujte do Leonardovho domu pokojnou chôdzou. Cestou si pohovoríte o súde Francesca Pazziho, na ktorom má svedčiť aj váš otec. Keď dorazíte k cieľu, zvíta sa s Leonardom, ktorý pre ňu pripravil pár obrazov. Sú v krabici, tak ju vezmite a vydajte sa naspäť domov. Sem ste sledovali matku, teraz vediete vy. Cestou si pohovoríte s Leonardom. Doma zložte krabicu pred dverami, rozlúčite sa a úloha je splnená. 8. Zbite podvodníka (Beat a cheat) Posledná na vás čaká vaša sestra, Claudia Auditore. Je smutná, pretože ju jej milý Duccio podvádza. Chce, aby za to pykal, takže si to beriete na starosť. Zájdite na miesto, kde je Duccio a uvidíte, ako sa očividne dvorí inej žene. Po scénke vás čaká boj, no je to skôr symbolické, lebo je Duccio slabý. Zbite ho, kým sa nedá na útek a úloha je splnená. Splnenie misie sprístupňuje: úlohu Bitkár „Ohrdnutá žena“. 9. Špeciálna donáška (Special Delivery) Vráťte sa domov za otcom. Giovanni už má pre vás ďalšiu úlohu. Máte doručiť dva balíčky pre jeho spoločníkov a priniesť mu správu z holubníka. Proste zájdite na tri označené miesta. Na dvoch odovzdáte listy podivným indivíduám a na treťom je na streche holubník, z ktorého vyberte správu. Tým je proste úloha splnená. 10. Kriminálnik (Jailbird) Vráťte sa domov a prekvapí vás tam vaša slúžka Annetta, ktorá vám povie, že vášho otca a bratov zatkli a odviedli do žalára. Matka so sestrou sa našťastie ukryli. Ste rozhodnutý dostať sa k otcovi a zistiť, čo sa stalo. Choďte k väzeniu. Je to červená, teda neprístupná oblasť a tak tam na vás budú stráže hneď reagovať nepriateľsky. Vylezte jednoducho zo strany s lešeniami nahor. Na plošine a hore na terase je po jednom strážcovi. Môžete sa ich zbaviť, zabiť ich v boji, alebo zhodiť dolu. Keď ste na terase, vylezte na väzenskú vežu k cieľovému oknu, kde je cela vášho otca. Nemáte vraj čas na vysvetľovanie, posiela vás naspäť domov, aby ste našli tajné dvere v jeho pracovni a vzali si všetko z truhlice, ktorú za nimi nájdete. Má tam byť aj list, ktorý máte odniesť Umbertovi, ktorého ste dnes stretli v otcovej pracovni. Po rozhovore zoskočte do sena pod vami. 11. Rodinné dedičstvo (Family Heirloom) Vráťte sa domov a vojdite do budovy. Použite v pracovni svoj Orlí zrak (E) a uvidíte žiariacu stenu. Aktivujte ju a odhalí sa tajná miestnosť. V nej otvorte truhlicu, z ktorej si vyberiete meč, list, stránku kódexu a nový oblek vraha. Vyjdite von a na dvore vás napadnú dvaja strážci s mečmi, takže si hneď môžete preskúšať vaše bojové schopnosti s vaším mečom. Bojujete v podstate podobne ako päsťami. Útočíte, alebo sa kryjete a využívate kombo protiútok. Potom len zájdite k domu pána Umberta a odovzdajte mu list od otca. Povie vám, že by mal obsahovať dôkazy o spiknutí proti mestu aj vašej rodine a že tieto dôkazy zajtra predloží, aby boli oslobodení. Získali ste: Stránku Kódexu. 12. Posledný preživší (Last Man Standing) Zájdite na označené miesto, kde sa má konať súd. Zrejme nie ste prekvapený, keď zistíte, že vás Umberto Alberti zradil. Váš otec a bratia, Giovanni, Federico a Petruccio sú obvinení zo zrady, odsúdení na smrť a popravení. Nepodarí sa vám ich zachrániť a len na seba upútate pozornosť a Umberto na vás pošle stráž. Je ich veľa a vy sám, takže sa zbytočne nepokúšajte bojovať a dajte sa radšej na útek. Utekajte preč a buď sa niekde ukryte, alebo len utečte z dosahu stráží. Keď budete mimo ich dosahu, tak je úloha skončená. Tým je ukončená aj prvá sekvencia.